Alapszínek

Az alapszíneket (fekete, pej, sárga) össz-vissz 2 allélpár határozza meg. Ezek döntik el, hogy mennyi vörös, illetve fekete szín van a lóban.

 
E- Extension gén

  ’E, e’ betűkkelel jelöljük. Általában a ló genetikai 'kódjában' előre írjuk, mivel ez adja az első támpontunkat. Az Extension azt határozza meg, hogy vörös és fekete, vagy csak vörös pigmentek termelődhetnek-e. Domináns, azaz 'Ee' vagy 'EE' formában megadja, hogy a ló egyaránt képes fekete és vörös pigmentek termelésére is, ezt látjuk fekete és pej lovaknál. Recesszív formában, azaz 'ee'-ként a lóban nincs fekete, csak vörös pigment, ez a sárga alap jellemzője.

A- Agouti gén

  ’A, a’ betűkkel jelöljük az Agouti gént, ami az Extension-nel együttműködve megszabja, hogy hol helyezkedjen el a vörös és a fekete pigment. Ez a gén dominánsan, 'AA' vagy 'Aa' úgymond felülírja a fekete (E) színezetet, és azt visszaszorítja a pontokra (lábak, orr) és a hosszúszőrökre. Tehát ha egy domináns Extension-ű (EE, Ee) lóhoz domináns agouti gén is társul, akkor az pej lesz, a lábak, hosszúszőrök az Extension génnek köszönhetően feketék, ugyanakkor az Agouti hatással van a test színére, ami ettől barna, vörös, stb lesz. (a pej bármely árnyalata) tehát pej lovakban mindig jelen van domináns agouti.
A fekete lóban ugyanakkor az Extension az egész testükre kifejtheti hatását, tehát nincs bennük Agouti domináns formában, ők minden esetben 'aa' genotípusúak, csak recesszíven van jelen.
 A sárga lovak egy érdekes helyzet, mivel nekik vörös alapjuk (ee) van, így a testszínük alapból is vörös, az agouti rájuk nem fejt ki látható hatást. Tehát egy sárga lóban lehet, hogy van agouti (pl ee/Aa a genotípusa), de az is lehet, hogy nincs (ee/aa) Ez az esetből fontos, hogy milyen csikói születhetnek a jövőben.

Szóval összefoglalva:

A fekete lóban mindenképpen van legalább egy domináns E, viszont Agouti, azaz vörös csak recesszív formában, azaz minden esetben aa.
Így tehát egy fekete ló genotípusa 2 féle lehet:
   -EE/aa (homozigóta, csak fekete vagy pej csikója lehet)
   -Ee/aa (heterozigóta, fekete, pej, vagy sárga csikója lehet)
Itt most csak azokkal számoltam, ha a ló párja is alapszínű.

A pej lóban mindenképpen van legalább egy domináns E, és egy domináns A.  Lehet homozigóta vagy heterozigóta is.
A pej ló genotípusa igen változatos lehet:
   -EE/AA (homozigóta fekete és agouti, egy ilyen lónak csak pej csikója lehet)
   -EE/Aa (feketére homozigóta, agoutira hetero, születhet fekete vagy pej csikója)
   -Ee/AA(het. Fekete, hom. Agouti, pej vagy sárga csikója lehet)
   -Ee/Aa (het fekete és agouti, pej, fekete vagy sárga csikója lehet)

A sárga lóban fekete nincs, Extension csak recesszíven (ee) lehet, agouti pedig vagy van, vagy nincs. Két sárga lónak csak és kizárólag sárga csikója születhet.
A sárga ló genotípusai:
   -ee/aa (recesszív hom. Fekete és agouti, fekete, pej, sárga csikója lehet)
   -ee/Aa (rec. Hom. Fekete, heterozigóta agouti, fekete, pej, sárga csikója lehet)
   -ee/AA (fekete recesszíven, agouti homozigóta domináns formában, csak pej vagy sárga csikója lehet.)

 Ez a 3 hivatalos alapszín van, a genetikában árnyalatokról nem beszélünk, mivel az árnyalatok teljesen szubjektívek, és a kutatások sem tártak fel semmit a különböző árnyalatok genetikájában. Tehát ugyanaz érvényes a májsárga, és a normál sárga, vagy a sötétpej és a világospej lovakra e tekintetben.

Akkor megint jöhet pár példa :D
Szülők: homozigóta fekete kanca (EE/aa) és heterozigóta sárga mén (ee/Aa)
 

Szülők: heterozigóta pej kanca (Ee/Aa) és heterozigóta sárga mén (ee/Aa) itt már nagyobb táblázatot kell használni, mert sok variáció lehet arra, hogy mit ad tovább a kanca.